A Escola Ciência Viva é acompanhada e avaliada de forma contínua e independente por investigadores do Centro de Investigação e Estudos de Sociologia do ISCTE–IUL.
Através de uma metodologia de observação e acompanhamento das actividades, entrevistas e inquéritos a professores e encarregados de educação, a equipa de investigadores avalia as condiçõs de desenvolvimento da Escola Ciencia Viva e o seu impacto na população escolar e na comunidade envolvente.
O objectivo deste acompanhamento é o de reunir informação independente para uma reflexão crítica sobre a acção da Escola Ciência Viva, tendo em vista não só o seu aperfeiçoamento mas também a disseminação das suas práticas e resultados em novos contextos educativos.